丰台单细胞测序技巧运用于癌症无创诊断

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2013年12月10日知名学术期刊美国《国度科学院院刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences USA)在线揭橥了北京 学性命科学学院生物动态光学成像中间谢晓亮、白凡课题组与北 肿瘤病院王洁团队合作的研讨成果。在题为“Reproducible copy number variation patterns among single circulating tumor cells of lung cancer patients”的研讨论文中，研讨人员经由过程单细胞基因测序手腕初次报道了对于癌症病人单个外周血轮回肿瘤细胞的全基因组、外显子组测序成果，此项研讨对于揭示癌症转移的分子机制具有主要意义，同时还为无创癌症诊断供给了一种新的技巧手腕。肿瘤的转移是导致癌症病人逝世亡的重要原因。早在1896年，澳 利亚籍大夫Ashworth初次在癌症病人血液样品中不雅察到轮回肿瘤细胞（Circulating Tumor Cell, CTC）的存在。在肿瘤转移进程中，癌细胞从原发肿瘤脱落，进入血液或淋巴轮回体系，个中一些具有高度转移潜能的肿瘤细胞在轮回体系中存活下来，成为轮回肿瘤细胞，并进一步成长为远端器官转移肿瘤。轮回肿瘤细胞是肿瘤产生远处转移的必经步调，是以在外周血中检测到肿瘤细胞预示着有产生肿瘤转移的可能。近些年来，对于癌症病人血液中CTCs的计数已逐渐用于癌症治疗的疗效评估。假如能对CTCs进行基因组剖析将有助于我们更好地懂得肿瘤转移的生物学机制；同时，作为一种非侵袭性的检测手腕，CTCs的基因组剖析还可认为疗效评价、预后断定以及个别化治疗供给实时靠得住的根据。然而，因为轮回肿瘤细胞在病人外周血中存在的数目极其稀疏，对其进行基因组测序具有较 难度。在此项研讨中，研讨人员应用了哈佛 学谢晓亮组最新创造的多重退火和环化轮回的扩增技巧(MALBAC)胜利实现了对于来自癌症病人外周血单个轮回肿瘤细胞的全基因组扩增和深度测序。MALBAC技巧具有基因组扩增平均，笼罩率浩瀚优势，从而使得研讨人员可以在单个细胞程度探测全基因组基因拷贝数变异(CNVs)和单核苷酸变异(SNVs)。研讨人员重点研讨了肺癌患者外周血轮回肿瘤细胞的分子特征。在来自浩瀚肺腺癌患者和小细胞肺癌患者的轮回肿瘤细胞中，胜利检测到与癌症产生成长相干亲密的原癌基因和抑癌基因上的主要单核苷酸变异和插入/缺掉。单细胞程度CTCs的基因突变的检测避免了重复穿刺活检给病人带来的损害和苦楚, 并能实时地供给个别化治疗所需的主要信息，例如导致癌症转移进程中产生表型转换的主要突变，以及癌症治疗进程中发生耐药性的主要突变。研讨进程中研讨人员不测地发明来自统一个病人的分歧CTC都展示出高度一致的全基因组拷贝数变更模式，和统一病人的转移位肿瘤组织的拷贝数变更模式一致。这种现象在肺腺癌和小细胞肺癌的病人中都获得了验证。此外，在分歧的肺腺癌病人中，CTC展示的全基因组拷贝数变更模式具有高度的类似性。肿瘤的异质性历久以来被看成是恶性肿瘤的主要特点。 初次在CTC中不雅察到的高度一致的拷贝数变异模式将会转变传统上对肿瘤异质性的懂得，揭示了特定的拷贝数变异在肿瘤形成及转移中施展了主要的感化。进一步研讨发明，小细胞肺癌患者的拷贝数变异模式与那些肺腺癌患者显著分歧，展示出癌种之间必定的特异性。这种特异性可能跟肿瘤成长、转移所处的微情况相干。这项发明为未来基于CTC拷贝数变异来进行癌症病人分型供给了理论基本。北京 学生物动态光学成像中间白凡副研讨员、中间主任谢晓亮传授以及肿瘤病院王洁传授及为该论文的配合通信作者。倪晓晖博士和在读研讨生苏哲、高妍是这篇论文的并列作者。该项研讨获得了北京 学985临床病院合作专项经费、青年千人筹划科研启动经费以及国度出色青年基金的支撑。 网站网友点击量更高的文献目录排行榜： 点此链接 关注页面底部公众号，开通以下权限： 一、获得问题咨询权限。 二、获得工程师维修技术指导。 三、获得软件工程师在线指导 toupview,imageview,OLD-SG等软件技术支持。 四、请使用微信扫描首页底部官主账号！