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一般教学微生物试验中细胞常用革兰氏染色方法
还有一些常用的鉴别染色法—抗酸性染色法，主要用于分枝细菌
Mycobacterium，也是很重要的。
另外的一些染色法可用于显示细胞的某些特殊的组成如
鞭毛、芽胞、荚膜、细胞壁，呼吸作用活性中心等等。
染色法的用途很大，但一定要谨慎使用，因为它们可能造成错误
染料分子有时形成沉淀或聚集物，它们仿佛是真正细胞结构
这种由染料本身引起的形成物叫做瓜体(artifacts)，
人们应当注意不要把这种质体认为是真实结构。
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