宁波 学等《Cell》解析DNA甲基化

加州 学河干分校整合基因研讨所植物科学中间，植物病例学中间，台湾台中国立中兴 学生物技巧研讨所，宁波 学科学与技巧学院等处的研讨人员在最新的一期《Cell》上揭橥DNA甲基化研讨结果，An Effector of RNA-Directed DNA Methylation in Arabidopsis Is an ARGONAUTE 4- and RNA-Binding Protein。

在基因组中除了DNA和RNA序列以外，还有很多调控基因的信息，它们固然自己不转变基因的序列，然则可以经由过程基因润饰，卵白质与卵白质、DNA和其它分子的互相感化，而影响和调节遗传的基因的功效和特征，而且经由过程细胞决裂和增殖周期影响遗传，这就是表不雅遗传学（epigenetics）。

在表不雅遗传学研讨中，小分子RNAs（Short interfering RNAs，siRNAs）可以引诱DNA甲基化，以及异染色质组卵白润饰，导致序列特异性转录基因缄默。这一路径称为RNA介导的DNA甲基化路径（RNA-directed DNA methylation，简称RdDM）。

在本研讨中，研讨人员判定了一个RdDM的效应器（RdDM effector），KTF1。KTF1产生功效性损失的突变会导致DNA甲基化水平变小，并释放出缄默RdDM转座子的siRNA，增进缄默RdDM路径。KTF1与转录延长因子（transcription elongation factor）SPT5类似，其C端富含GWWG反复序列。

KTF1与ARGONAUTE4（AGO4）一路定位在焦点地位，并与AGO4和RNA转录因子联合。

研讨成果注解，KTF1是一个连接卵白，它同时链接AGO4和Pol V发生的转录因子网路，AGO4联合到siRNA，以上的分子联合在一路形成RdDM效应复合物。这种复合效应器的特点是具有双重的联合感化，同时联合AGO4和转录因子。
原文检索：An Effector of RNA-Directed DNA Methylation in Arabidopsis Is an ARGONAUTE 4- and RNA-Binding Protein

【Summary】

DNA methylation is a conserved epigenetic mark inplants and mammals. In Arabidopsis, DNA methylation can be triggered by small interfering RNAs (siRNAs) through an RNA-directed DNA methylation (RdDM) pathway. Here, we report the identification of an RdDM effector, KTF1. Loss-of-function mutations in KTF1 reduce DNA methylation and release the silencing of RdDM target loci without abolishing the siRNA triggers. KTF1 has similarity to the transcription elongation factor SPT5 and contains a C-terminal extension rich in GW/WG repeats. KTF1 colocalizes with ARGONAUTE 4 (AGO4) in punctate nuclear foci and binds AGO4 and RNA transcripts. Our results suggest KTF1 as an adaptor protein that binds scaffold transcripts generated by Pol V and recruits AGO4 and AGO4-bound siRNAs to form an RdDM effector complex. The dual interaction of an effector protein with AGO and small RNA target transcripts may bea general feature of RNA-silencing effector complexes.