显微镜下血管炎文博研究组分析了核基质蛋白H

大家好，这里是老上光显微镜知识课堂，在这里你可以学到所有关于显微镜知识，好的，请看下面文章： 2-3米的真核DNA如何折叠成直径几微米的细胞核，并以有序的方式调节基因组功能近年来，基于高通量染色体构象捕获技术（如Hi-C）的研究表明，染色体可以折叠成不同的层次结构，例如：以前的研究表明，CTCF、Rad21等结构蛋白在TAD边界的形成中起着重要作用，但对于TAD的结构没有全局调节作用的生物大分子。发现了不同水平的染色质。
    
     复旦大学基础医学院和生物医学研究所双聘PI Wenbo研究小组在核基质蛋白对高水平染色质结构整体调控的研究方面取得了重要进展。在基因组研究中公布的老鼠肝细胞中，3D基因组结构遍布全球。
    
     本研究以具有完整核型维持的小鼠肝细胞为模型，采用高通量测序技术，如Hi-C、DamID、ChIP-seq、RNA-seq、光学显微技术，系统地研究了核基质蛋白HNRNPU对三维基因组结构(3D.me)的调控作用。镜检和电镜观察发现，当HNRNPU表达降低时，染色质与层粘连，即LAD之间的相互作用发生显著变化，导致16.6%的基因组从非LADs向LADs转变。电镜结果还表明，染色质重新分布于细胞核边缘，7.5%的基因组发生了间隔型转移，间隔内和间隔与TAD之间的远距离相互作用也发生了显著变化。此外，ChIP-seq实验表明，HNRNPU主要结合在活性染色质区，80%的结合位点与CTCF或RAD21重叠。HNRNPU对染色质结构的调节作用，提示核基质在3D基因组的组织中起着普遍的作用，为揭示染色质在结构中的形成与维持的分子机制提供了新的依据。
    
     本文作者是文博，范辉博士生和陆平博士生是合著者，霍向如、王千峰等同学协助完成。埃默里大学吴昊教授，项目由科技部重大科学研究计划（2015CB943000）和自然科学基金（31371296）资助。
    
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